Erst nach 1500, nach der Entdeckung Amerikas kam die Kapuzinerkresse nach Europa, deshalb wird sie auch als Neophyt bezeichnet. Sie gehört zur Familie der Kapuzinerkressengewächse (Gattung der Kreuzblüterartigen Brassicales). Die ursprüngliche Heimat der Kapuzinerkresse ist das Andengebiet Perus und Boliviens, sie wurde aber auch in den kühleren Regionen Mittel- und Südamerikas angebaut. Bereits die Inkas nutzten sie als Garten- und Heilpflanze, vor allem als Schmerz- und Wundheilmittel.